Spacial transcriptome & scRNA-Seq 연구자를 위한
GeoMx & RNA-seq / Single cell RNA-Seq
무료 데이터분석 워크샵 안내
신청방법 및 세부사항
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신청방법
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신청서 작성후 이메일로 신청
신청서 다운로드(클릭)
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교육시간
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오전 9시 30분 또는
오후 2시(약 3시간 소요)
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분석워크샵 장소
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(주)이바이오젠 본사 대회의실
서울특별시 성동구 뚝섬로17가길 48 성수에이원센터 4층 406호
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준비사항
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노트북(마우스 포함)
프로그램 설치 및 샘플데이터 다운로드(신청확정 후 안내)
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분석 워크샵 교육내용
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GeoMx & RNA-seq (오전)
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Single cell RNA-Seq (오후)
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1. GeoMx Spatial Transcriptome 개요
2. 분석 실습 1부
(GeoMx 결과 포맷 & ExDEGA 를 활용한 RNA-seq 발현분석)
3. 분석 실습 2부
(RNA-seq 추가분석 (GSEA, Cytoscape Network))
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1. scRNA-Seq 개요 : scRNA-Seq 소개, 전반적인 이론 및 분석소개
2. 분석 실습 1부
(10x Loupe Browser 활용한 발현분석 및 cell type identification)
(ExSCEA Report 활용한 scRNA 발현분석)
3. 분석 실습 2부
(WinSeurat 활용한 scRNA-Seq customized option 적용 분석)
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▶ 분석워크샵 신청 및 문의 : 02-3141-0791, [email protected]
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ExDEGA & WinSeurat Screenshot
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ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Microarray 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다.
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WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.
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(주)이바이오젠, Never Ending Service, 항상 최선을 다하겠습니다.
Tel. 02-3141-0791, Fax. 02-3141-0792, www.e-biogen.com
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