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** LC-MS/MS Proteomics Service with Exploris 480 **
| Sample type |
Cell pellet, Tissue, Serum/Plasma, Conditioned Media, Exosome, Gel piece, Extracted Protein |
| Requirement |
UniProt DB가 존재하는 모든 종에 대해 분석가능 |
| Equipment |
LC: Thermo Dionex-UltiMate 3000 & Agilent 1290 / MS: Thermo Quadruple Orbitrap Exploris 480 MS |
| Turnaround time |
~ 6 weeks after Protein QC (시료 개수가 많아지면 기간소요 달라짐) |
| Features |
Data dependent Analysis(DDA) 방식 진행
High Accuracy Mass Spectrometry 기반의 Proteomics 분석서비스로 시료에 따라 수백 개에서 수 천개의 단백질 ID를 할 수 있음
상대 정량 발현 비교 분석 가능
Q-Exactive 보다 많은 Peak를 MS2로 scan가능하기 때문에 Protein ID 수가 증가
Merge건은 반드시 상담 요망
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Proteomics Data Analysis
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| ** 다양한 DEP 분석 및 Visualization & ExDEGA Report ** |
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Gene Category 분석 및 사용자 맞춤형 protein set 분석
Significant protein대상 GO 그래프 및 filtering
Scatter Plot, Volcano Plot, Heatmap 제공
Venn Diagram 분석 및 해당 영역 protein filtering
KEGG Mapper – Search & Color Pathway Support
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DAVID Functional Annotation Support
Protein-protein Interaction Analysis(String/Cytoscape)
Network & Correlation Analysis
PRIDE Submission 가이드라인 제공
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ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Proteomics 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다. ExDEGA 분석툴은 이바이오젠에서 제공하는 RNA-seq 및 Microarray 데이터(엑셀 파일)에서만 사용하실 수 있습니다.
세부정보 >> Software & Data Analysis
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