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** Enzymatic Methyl-Seq(EM-Seq) Service **
| Sample requirement |
>2ug gDNA |
| Library method |
NEBNext® Enzymatic Methyl-seq Kit |
| NGS run format |
NovaSeq 6000, PE150 |
| Data yield |
~120Gb/sample |
| Turnaround time |
~ 6 weeks after DNA QC |
| Sample type |
gDNA** |
| ** gDNA prep.이 필요할 경우 상담 후 진행이 가능합니다. |
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EM-Seq Data Analysis
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ExPADA(Excel based Peak Annotation and Differential enrichment Analysis)는 연구자들이 DNA-Seq (ChIP-Seq, EM-Seq, ATAC-Seq) 데이터를 보다 쉽고 직관적으로 다룰 수 있도록 만든 엑셀 기반의 분석 도구입니다. DNA-Seq (ChIP-Seq, EM-Seq, ATAC-Seq)의 분석 결과로부터 ExPADA를 이용하여 유용한 정보를 얻을 수 있습니다. ExPADA는 사용자들의 요구사항을 지속적으로 반영하여 엑셀 사용에 익숙하지 않은 연구자들도 쉽게 사용할 수 있도록 지속적으로 업데이트 될 예정입니다.
세부정보 >> Software & Data Analysis
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Gene Ontology 분석
Cluster 별 Significant data analysis
Volcano Plot 작성 및 gene marking
Venn Diagram 분석 및 해당 영역 gene filtering
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KEGG Mapper – Search&Color Pathway Support
MeV Clustering Heatmap Support
DAVID Functional Annotation Support
Selected genes 발현 패턴 그래프 작성
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