RNA-Seq & Single cell RNA-Seq 데이터분석
(2021년 3분기)비대면 무료 워크샵 일정 안내
대상자 : RNA-Seq, scRNA-Seq 고객 및 국내 연구자
참석인원 제한 : (최대 15명, Lab당 1명)/Class, 한개 Class만 신청가능
코로나19 때문에 비대면으로 진행하고 원활한 진행을 위해 접속자 제한이 있습니다.
2021년 3분기 분석워크샵 일정
▶ RNA-Seq(Advanced) : 7월 15일(목), 8월 12일(목), 9월 9일(목)
▶ Single cell RNA-Seq : 7월 22일(목), 8월 19일(목), 9월 16일(목)
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신청방법 및 세부사항
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신청방법
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신청서 작성후 이메일로 신청
신청서 다운로드(클릭)
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교육시간
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오전 9시 또는
오후 2시(약 3시간 소요)
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비대면 방식
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온라인 접속후 강의&실습
(사전에 온라인접속 방법안내)
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준비사항
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노트북(마우스 포함)
프로그램 설치 및 샘플데이터 다운로드(신청확정 후 안내)
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분석 워크샵 교육내용
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RNA-Seq Advanced Class
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Single cell RNA-Seq
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ExDEGA 분석툴 유경험자 대상으로 GSEA, MeV, Cytoscape 프로그램 교육
- 1부 -
ExDEGA 데이터분석 개요
MeV(Clustering) 프로그램 활용
GSEA 프로그램 활용
- 2부 -
Cytoscape-String Network 활용
Cytoscape-ClueGO 활용
Cytoscape-Custom Network 활용
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1. scRNA-Seq 개요 : scRNA-Seq 소개, 전반적인 이론 및 분석(Cell Ranger, Seurat) 안내
2. ExSCEA 이용 발현분석 : Cell Ranger 분석 기반의 ExSCEA, Loupe를 활용한 scRNA-Seq 분석 실습
3. WinSeurat 활용 : WinSeurat 분석툴을 활용한 scRNA-Seq 분석 실습
(QC, Normalization, PCR, SCTransform, Integration, Clustering, Marker Identification, DE Analysis)
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분석워크샵 신청 및 문의 : 02-3141-0791, [email protected]
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ExDEGA & WinSeurat Screenshot
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ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Microarray 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다.
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WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.
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(주)이바이오젠, Never Ending Service, 항상 최선을 다하겠습니다.
Tel. 02-3141-0791, Fax. 02-3141-0792, www.e-biogen.com
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